Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAV1Q03135 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAV1Q03135 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms