Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms