Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLCB3Q01970 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLCB3Q01970 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms