Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC6A3Q01959 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms