Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms