Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK17Q00537 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms