Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK16Q00536 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK16Q00536 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms