Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMF1P82094 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMF1P82094 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMF1P82094 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMF1P82094 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMF1P82094 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMF1P82094 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMF1P82094 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMF1P82094 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMF1P82094 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMF1P82094 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMF1P82094 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMF1P82094 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms