Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPC5P78333 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPC5P78333 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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