Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK-24P63145 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK-24P63145 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms