Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBA52P62987 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBA52P62987 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBA52P62987 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBA52P62987 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms