Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms