Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPEP62304 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms