Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms