Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UFM1P61960 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UFM1P61960 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UFM1P61960 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms