Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms