Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EMP1P54849 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EMP1P54849 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP1P54849 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP1P54849 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EMP1P54849 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms