Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms