Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUCLG1P53597 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms