Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACLYP53396 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACLYP53396 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACLYP53396 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACLYP53396 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACLYP53396 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms