Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDST1P52848 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDST1P52848 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms