Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK4P51957 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK4P51957 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK4P51957 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK4P51957 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK4P51957 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEK4P51957 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms