Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP11P51784 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP11P51784 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP11P51784 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP11P51784 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP11P51784 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP11P51784 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms