Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC3P51654 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC3P51654 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC3P51654 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC3P51654 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC3P51654 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC3P51654 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC3P51654 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms