Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms