Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POU3F4P49335 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POU3F4P49335 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms