Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms