Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP1P48552 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms