Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCLMP48507 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCLMP48507 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCLMP48507 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCLMP48507 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCLMP48507 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms