Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP5P45974 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP5P45974 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP5P45974 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP5P45974 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP5P45974 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP5P45974 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP5P45974 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP5P45974 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP5P45974 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP5P45974 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP5P45974 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms