Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms