Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC5P40937 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC5P40937 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC5P40937 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC5P40937 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC5P40937 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC5P40937 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC5P40937 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms