Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MLH1P40692 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MLH1P40692 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MLH1P40692 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms