Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGAEP38570 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms