Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZEB1P37275 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms