Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCAP28676 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GCAP28676 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCAP28676 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCAP28676 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCAP28676 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCAP28676 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCAP28676 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCAP28676 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms