Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSFA2P28290 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms