Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APEX1P27695 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APEX1P27695 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APEX1P27695 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APEX1P27695 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APEX1P27695 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APEX1P27695 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APEX1P27695 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APEX1P27695 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APEX1P27695 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APEX1P27695 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APEX1P27695 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms