Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B4P23634 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B4P23634 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms