Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRDP23468 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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