Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCP20941 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCP20941 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCP20941 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCP20941 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDCP20941 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDCP20941 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDCP20941 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCP20941 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms