Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms