Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGCP20142 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGCP20142 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGCP20142 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms