Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCLP19338 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCLP19338 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCLP19338 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCLP19338 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCLP19338 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCLP19338 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCLP19338 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCLP19338 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms