Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DESP17661 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DESP17661 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DESP17661 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DESP17661 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DESP17661 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms