Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB3P16520 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB3P16520 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB3P16520 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB3P16520 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB3P16520 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB3P16520 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB3P16520 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB3P16520 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB3P16520 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GNB3P16520 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms