Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MUC1P15941 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MUC1P15941 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MUC1P15941 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MUC1P15941 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MUC1P15941 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MUC1P15941 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MUC1P15941 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms