Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DOBP13765 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms