Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms