Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB1P11230 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms